Jaký je rozdíl mezi 16s rRNA a 18s RRNA?
Jaký je rozdíl mezi 16s rRNA a 18s RRNA?

Video: Jaký je rozdíl mezi 16s rRNA a 18s RRNA?

Video: Jaký je rozdíl mezi 16s rRNA a 18s RRNA?
Video: Pět největších světových náboženství - John Bellaimey 2024, Listopad
Anonim

Hlavní rozdíl mezi provádění analýz s 18S rRNA genová data místo toho 16S rRNA genová data (nebo data ITS) jsou referenční databází používanou pro výběr OTU, taxonomické přiřazení a vytváření zarovnání na základě šablony, protože musí obsahovat eukaryotické sekvence.

Vzhledem k tomu, proč se k identifikaci používá gen 16s rRNA?

The 16S ribozomální RNA gen kóduje RNA složku podjednotky 30S bakteriálního ribozomu. Vzhledem ke složitosti hybridizace DNA-DNA, 16S rRNA gen sekvenování je použitý jako nástroj k identifikovat bakterií na druhové úrovni a pomáhají s rozlišením mezi blízce příbuznými bakteriálními druhy [8].

Navíc mají eukaryota 16s rRNA? The 16S rRNA gen je přítomen ve všech bakteriích a příbuzná forma se vyskytuje ve všech buňkách, včetně buněk z eukaryota.

Otázkou také je, co je 18s a 28s rRNA?

The 28S / 18S ribozomální RNA poměr se často používá k hodnocení kvality celkové RNA purifikované z jakéhokoli daného vzorku. u lidí, 28S rRNA má ~5070 nukleotidů a 18S má 1869 nukleotidů, což dává a 28S / 18S poměr ~2,7. Výška 28S / 18S poměr je indikací, že purifikovaná RNA je intaktní a nedegradovala.

Co je sekvenování 16s rRNA?

16S rRNA gen sekvence analýza je standardní metodou v bakteriální taxonomii a identifikaci a je založena na detekci sekvence rozdíly (polymorfismy) v hypervariabilních oblastech 16S rRNA gen, který je přítomen ve všech bakteriích.

Doporučuje: